ИССЛЕДОВАНИЯ МОЛЕКУЛЯРНОГО ДОКИНГА ХИНАЗОЛИНОВЫХ АЛКАЛОИДОВ PEGANUM HARMALA И ИХ СИНТЕТИЧЕСКИХ АНАЛОГОВ
Энергии связывания хиназолиновых алкалоидов из Peganum harmala L. и их синтетических производных с ферментом
AXЭ были оценены с помощью исследований молекулярного докинга. Наши результаты показывают, что π−π-
взаимодействия между аминокислотными остатками и лигандами существенно влияют на комплексы AXЭ-лиганд. Кроме
того, ориентация взаимодействующих ароматических колец – параллельная или под определенными углами – имеет
решающее значение для эффективного связывания. Среди теоретических соединений, полученных из
дезоксипеганинового скелета, лиганды с ароматическими заместителями продемонстрировали относительно сильное
взаимодействие с AXЭ, что подтверждено докингом и анализом MMGBSA.
1. Agamah F.E., Mazandu G.K., Hassan R., Bope C.D., Thomford N.E., Ghansah A. Chimusa E.R. Computational/in silico
methods in drug target and lead prediction//Briefings in Bioinformatics. −2020. –Vol. 21(5).−P.1663-1675.
2. Sumontri S., Eiamart W., Tadtong S., Samee W. Utilizing ADMET Analysis and Molecular Docking to Elucidate the
Neuroprotective Mechanisms of a Cannabis-Containing Herbal Remedy (Suk-Saiyasna) in Inhibiting
Acetylcholinesterase//Int. J. Mol. Sci. −2025. –Vol. 26. –P.3189.
3. Дъяконов А.Л., Тележенецкая М.В. Хиназолиновые алкалоиды в природе//Хим. Природ. Соедин.-1997. -№3. –С.297-
351.
4. Садритдинов Ф.С., Курмуков А.Г. Фармакология растительных алкалоидов и их применение в медицине. Ташкент:
Медицина, 1980. С. 301-305.
5. Туляганов Н. Фармакологические исследования алкалоидов гармалы обыкновенной (Peganum harmala L.)
хиназолинового и хиназолонового строения и их производных. Автреф. дисс. д-ра мед. наук: 14.00.25-фармакология.
−Москва, 1981. −28 с.
6. Шахидоятов Х.М. Хиназолоны-4 и их биологическая активность. –Т.: Фан, 1988. -138 с.
7. Liu Y., Yang X., Gan J., Chen S., Xiao Z-X., Cao Y. CB-Dock2: Improved protein–ligand blind docking by integrating
cavity detection, docking, and homologous template fitting//Nucleic Acids Research. –2022. –Vol. 50(W1). –W159–W164.
8. Abraham M. J., Teemu M., Roland S., Szilárd P., Jeremy C.S., Berk H., Erik L. GROMACS: High performance molecular
simulations through multi-level parallelism from laptops to supercomputers//SoftwareX. –2015. –Vol.1. –P.19–25.
9. Lindorff-Larsen K., Piana S., Palmo K., Maragakis P., Klepeis J.L., Dror R.O., Shaw D.E. Improved side-chain torsion
potentials for the Amber ff99SB protein force field//Proteins. –2010. –Vol. 78(8). –P.1950-1958.
10. Sousa da Silva A.W., Vranken W.F. ACPYPE - AnteChamber PYthon Parser interface//BMC Res Notes. –2012. –Vol.5. –
P.367.
11. Valdés-Tresanco M.S., Valdés-Tresanco M.E., Valiente P.A., Moreno E. gmx_MMPBSA: A new tool to perform end-state
free energy calculations with GROMACS//J.Chem.Theory Comput. – 2021. –Vol. 17(10). –P.6281–6291.
12. Macdonald I.R., Martin E., Rosenberry T.L., Darvesh S. Probing the Peripheral Site of Human
Butyrylcholinesterase//Biochemistry. −2012. –Vol. 51(36). –P.7046–7053.
Copyright (c) 2026 «ВЕСТНИК НУУз»
Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution-NonCommercial-ShareAlike» («Атрибуция — Некоммерческое использование — На тех же условиях») 4.0 Всемирная.
.jpg)
2.png)
