ВЛИЯНИЕ ПЛАЗМЕННОГО ОКИСЛЕНИЯ НА СТРУКТУРУ БИОПОЛИМЕРА: МОДЕЛИРОВАНИЕ В АТОМНОМ МАСШТАБЕ
Загрузки
На изучении влияния реактивных форм кислорода (РФК), генерируемых ХАП, на биополимеры с помощью компьютерного моделирования. В частности, мы используем моделирование реактивной молекулярной динамики для исследования взаимодействия атомов кислорода (ключевого компонента РФК) с молекулой альгината, которая служит модельной системой в наших моделированиях.
1. Almeida F., Cavalcante R. S., Cullen P., Frias J., Bourke P., Fernandes F. and Rodrigues S. 2015. Effects of atmospheric cold plasma and ozone on prebiotic orange juice. Innovative Food Science & Emerging Technologies, 32 127-35.
2. Soignet D, Hinojosa O, Ward T and Benerito R 1982 The effects of plasma irradiation on saccharides Journal of Macromolecular Science—Chemistry 17 403-14
3. Yusupov M, Neyts E, Khalilov U, Snoeckx R, Van Duin A and Bogaerts A 2012 Atomic-scale simulations of reactive oxygen plasma species interacting with bacterial cell walls New Journal of Physics 14 093043
4. Zhao T, Shi L, Zhang Y, Zou L and Zhang L 2017 A ReaxFF-based molecular dynamics study of the mechanisms of interactions between reactive oxygen plasma species and the Candida albicans cell wall Physics of Plasmas 24 103518
5. Yusupov M, Privat-Maldonado A, Cordeiro R M, Verswyvel H, Shaw P, Razzokov J, Smits E and Bogaerts A 2021 Oxidative damage to hyaluronan–CD44 interactions as an underlying mechanism of action of oxidative stress-inducing cancer therapy Redox biology 43 101968
6. Cowman M K 2017 Advances in Carbohydrate Chemistry and Biochemistry, ed D C Baker: Academic Press) pp 1-59
7. Yusupov M, Dewaele D, Attri P, Khalilov U, Sobott F and Bogaerts A 2023 Molecular understanding of the possible mechanisms of oligosaccharide
8. Gaus M, Goez A and Elstner M 2013 Parametrization and benchmark of DFTB3 for organic molecules Journal of Chemical Theory and Computation 9 338-54
9. Gaus M, Lu X, Elstner M and Cui Q 2014 Parameterization of DFTB3/3OB for sulfur and phosphorus for chemical and biological applications Journal of chemical theory and computation 10 1518-37 10. Berendsen H J, Postma J v, Van Gunsteren W F, DiNola A and Haak J R 1984 Molecular dynamics with coupling to an external bath The Journal of chemical physics 81 3684-90
Copyright (c) 2025 Вестник НУУз
Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution-NonCommercial-ShareAlike» («Атрибуция — Некоммерческое использование — На тех же условиях») 4.0 Всемирная.
.jpg)
2.png)
